辽宁省食品发酵技术工程研究中心依托于沈阳农业大学食品学院，中心主任为乌日娜教授。该中心长期从事食品发酵基础理论、优良发酵菌种资源保护与利用、传统发酵食品现代化加工、健康发酵食品创制及安全控制等方面的研究和技术创新工作，在传统发酵食品现代化加工关键技术、优良益生菌株和益生元筛选和功能评价、益生菌及相关产品（益生元、合生元、后生元）创制及功能验证等方面，处于国内先进水平。

近年来，中心承担和完成了包括国家863、十二五、十三五、国家自然科学基金等100余项课题。发表学术论文800余篇，其中被SCI等三大检索系统收录的论文113篇，多篇入选ESI高被引论文，1篇论文入选2015—2019年“领跑者5000——中国精品科技期刊顶尖学术论文”。编著教材和著作22部，英文专著（Springer）2部，制定国家标准1部。主持完成的“益生菌Lactobacillus casei Zhang蛋白质组学研究”获全国百篇优秀博士论文提名奖、“干酪乳杆菌蛋白质组学研究”获中国食品科学技术学会科技创新二等奖、“益生菌在食品和人体肠道中的作用研究”获辽宁省自然科学奖、“Effect of Bile Salts Stress on Protein Synthesis of Lactobacillus casei Zhang Revealed by Two-Dimensional Gel Electrophoresis”获辽宁省自然学术成果特等奖、“功能益生菌资源高值化利用关键技术与产业化应用”获全国商业科技进步二等奖、“功能益生菌筛选与产业化关键技术及应用”获齐鲁农业科技奖二等奖、“东北传统发酵食品中有益微生物资源精准发掘及应用”获辽宁省科技进步奖三等奖等多项奖励和荣誉。

与伊利、蒙牛、辉山、双汇、雨润、青岛啤酒、山东康宝、宝来利来、科拓恒通、榆园食品、青花、汤泉一品、辽宁三彩、锦州百合、牧华合美、赛宝无抗、小缸酸菜等企业建立了长期合作关系，为企业出谋划策、提供技术指导、解决生产实际问题，多项成果在企业转化推广。与省内外多家家企业建立了产学研合作关系。