农产品深加工创新团队获批于2007年，创新团队依托沈阳农业大学食品学院和辽宁省农产品加工工程技术中心的基础上发展壮大起来的。几十年来，经过几代人的努力，团队不断发展壮大，已形成了研究方向齐全的创新团队。团队由食品学院入选辽宁省百千万人才工程百人层次、辽宁省教学名师孟宪军教授带领。团队现有工作人员69人，包教授11人、副教授8人、副研究员2人、讲师11人和一批科研水平高、业务能力强的博士后、博士、硕士生组成。承担国家自然基金8项，国家级项目15项，获得省级以上科研奖励5项，市级科研奖励10项，实现科研成果转化20余项。团队先后与省内外知名食品企业30余家建立合作关系，并与美国、英国、荷兰等国家部分高校建立了合作关系，实现国内外、产学研的深入融合。创新团队现有实验室面积2300多平方米。近五年来，投入的经费累计达3000多万元，购置了一系列先进的仪器设施。在后山生产基地建成了纯净水、饮料和乳品、焙烤、啤酒果酒、天然产物萃取、饼干、分离提取等生产线。这些设施条件为农产品研发和深加工奠定了扎实的基础，进一步提升了科学研究的水平和档次，为辽宁省农产品深加工的顺利开展提供了研发的基本条件和物质保证。